Fase ini berlangsung dengan sistem gugur atau knock-out.

• Ada Striker Gaek Cristian Gonzales, Berikut Daftar Nama Pemain PSIM Yogyakarta Untuk Liga 2

Juara grup bersua runner-up pool fase 16 besar dan hanya satu laga saja.

Pemenang laga ini akan langsung promosi ke Liga 1 musim berikutnya.

Tetapi, mereka akan tanding dalam partai final untuk menentukan juara Liga 2 2023-2024.

Tim yang kala akan bertandingan berebut posisi ketiga dan pemenangnya akan promosi ke Liga 1 musim selanjutnya.

Tim promosi ke Liga 1 adalah juara, runner-up, serta peraih peringkat tiga Liga 2 2023-2024.

Sementara itu, tim yang berada di posisi tiga terbawah setiap grup fase pendahuluan masuk babak 12 besar.

Mereka juga memainkan double round robin atau kompetisi penuh yaitu laga kandang dan tandang.

Tim yang berada di peringkat empat sampai enam dari babak 12 besar setiap grup bakal degradasi ke Liga 3 musim selanjutnya. Ada enam tim yang bakal turun kasta.

Jumlah pertandingan dari Liga 2 2023-2024 untuk pendahuluan adalah 168 laga.

Fase 16 besar berjumlah 112 pertandingan dan ada 60 laga dari babak 12 besar plus empat laga final four hingga grand final.

Total ada 344 pertandingan Liga 2 2023-2024 dengan jumlah game week sebanyak 38 pekan pertandingan.

Periode kompetisi Liga 2 musim depan adalah 3 September 2023 sampai 9 Maret 2024. Untuk status pemain, usia bebas dan berstatus profesional. (*)