Prestasi Tertinggi Persipura Lolos ke Semifinal Piala AFC, Klub Segudang Trophy Bersemayan di Liga 2

Mereka menang 3-0 atas Persita Tangerang di laga terakhir pada tanggal 31 Maret 2022, tapi itu tidak cukup dikarenakan Barito Putera, yang unggul 2 poin di klasemen sebelum laga tersebut, bermain imbang 1-1 melawan Persib.

Barito berada di atas Persipura lewat keunggulan rekor pertemuan meskipun berpoin sama.[

• Harga Pasaran Ramai Rumakiek Usai Persipura Terdegradasi ke Liga 2 & Umur Ramai Rumakiek Sekarang

Berikut Daftar Prestasi Persipura Jayapura:

- Liga kasta pertama

Perserikatan (1931-1994), Divisi Utama (1994-2008), Liga Super Indonesia (2008-15), Indonesia Soccer Champhionship A (2016), dan Liga 1 Indonesia (2017- 2022)

Juara : 2005, 2009, 2011, 2013,

Runner-Up (4): 1980, 2010, 2012,2014

- Liga kasta kedua

Divisi Satu (1979-2008), Divisi Utama (2008-15), Indonesia Soccer Champhionship B (2016) dan Liga 2 (2022-Sekarang)

Juara :1979,1993-94

- Piala Nasional

Piala Indonesia (2005-sekarang):

Runner-Up : 2006, 2008, 2009

Community Shield Indonesia

Juara : 2009

- Indonesia Inter Island Cup

Juara : 2011

- Turnamen (tidak resmi)

Indonesia Soccer Championship A:

Juara : 2016 (tidak resmi)

- Kejuaraan Asia

Liga Champions AFC

Juara (0)

Piala AFC

Juara (0):

Perempat Final: 2011

Semifinal: 2014

(*)